データの繰り返し処理やapply族を使ったデータフレームの処理などはデータ解析をする上では欠かせませんよね。 そんな時に役に立つのが{purrr}パッケージです。このパッケージは、今までfor-loopさせていた処理や、apply族を使っていた処理をスマートに処理…

前回は階層性のあるデータに対して、線形混合モデルと階層ベイズを用いて解析を行いました。 medi-data.hatenablog.com 今回は、より複雑な階層ベイズモデルに挑戦していきます。前回は扱わなった、新たなデータに対しての予測も行っていきましょう。 今回の…

前回はベイズ推定を使って単回帰分析を行いました。今回はさらにレベルを上げて階層性のあるデータ解析に挑戦していきます。 medi-data.hatenablog.com www.medi-08-data-06.work 階層性のあるデータの概略から、通常の単回帰、線型混合モデルそして、階層ベ…

Rで扱うことの多いデータフレームですが、みなさんはどのように処理をしているでしょうか？ 私は既存の{base}パッケージで処理を行なっていましたが、{dplyr}パッケージを知ってからというもの手放せなくなりました。 この{dplyr}を使うと驚くほど簡単に、そ…

今回は、Rのstanを使ってベイズ推定を使った単回帰分析を行なっていきます。 本来であればベイズ推定を使わなくても単回帰分析のパラメーターは推定できるのですが、stanに慣れるためにもまずは簡単なところからですね。 最後には通常の単回帰分析と結果の比…

前回の続きで、今回は主に連続型確率分布である正規分布、t分布を扱っていきます。ここまで理解できれば、統計が楽しくなるはずです！正規分布からt分布の導出までを出来るだけ式を使わずにまとめていきます！ 正規分布 z値 t分布 まとめ 正規分布 Z値 t分布…

統計検定をする上でよく用いられるのは有意水準ですが、同時に検出力も考慮しなければなりません。 今回は有意水準と検出力についてまとめてみます。 有意水準、検出力とは？ 第一種過誤（αエラー）、第二種過誤（βエラー）などとも呼ばれますが、簡単に言っ…

確率分布は統計学を学び始めると必ず出てくるワードなんですが、初めて聞いたときは、なんじゃそりゃ〜〜って感じで全然理解できませんでした。 正直SPSSやSASS、EZRなどの統計ソフトは値を入れれば、それっぽい結果が返ってくるので、学ぶ必要性を感じない…

前回は、Rにstanを導入して、実際に動かすところまで行いました。今回は、ベイズ推定で二項分布のパラメーターを求めてみます！ medi-data.hatenablog.com 二項分布とは ベイズの定理を使う前に、さらっと二項分布を復習しておきます。 二項分布とは、確率で…

新年になったということで、今年はRでstanを使ったベイズモデリングに挑戦していきたいと思います。 今回は導入編ということで、こちら RStan Getting Started · stan-dev/rstan Wiki · GitHub を参考にしながら進めていきます。ちなみに私のPCはMacですので…